LOINC 教育專區

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LOINC 使用及操作說明

LOINC 組成與內涵:

  1. LOINC 標準詞彙 LOINC term
    1. LOINC 代碼 (LOINC code):表示的是一個實務的檢驗事件。
    2. Fully Specified Name (FSN):六個軸向組合而成的檢驗事件名稱,表述模型如下,其中以冒號(:)區隔不同軸向
      <Analyte/component>:<kind of property of observation or measurement>:<time aspect>:<system (sample)>: <scale>:<method>
      如:禁食後的空腹血糖檢驗(單位mg/dL),LOINC FSN 表述為Glucose^post CFst: MCnc: Pt: Ser/Plas: Qn:。
    3. LOINC 名稱顯示方式:
      1. 長名稱 (Long Common Name) 較FSN能更清楚呈現LOINC縮寫的意涵,完整呈現檢驗事件。如上述例子Fasting glucose [Mass/volume] in Serum or Plasma。
      2. 臨床常見的顯示名稱 (Display Name) 又再更接近臨床的使用方式較長名稱更簡潔扼的清楚呈現檢驗事件,如上述例子 Glucose post fast [Mass/Vol]。
        自LOINC 2.64 版起開始發佈,目前在檢驗領域的應用多有存在其Display Name 內容,但其內容不一定符合LOINC 的唯一性。
  2. LOINC TERM 的六軸向結構
    1. 檢驗項目名稱 <Analyte/component> 結構,可分為三個部分,以" ^ "間隔,模型表示如下 :
      <[analyte]. [subclass]. [sub-subclass]> ^<[time delay] post [amount] [substance] [route])> ^<adjustment>
      1. 主要名稱(principal name): <[analyte]. [subclass]. [sub-subclass]>
        1. 兩種或多種成分作為一個量進行檢測,則每種成分應在主要名稱中命名,並用加號分隔。
          如:Coxsackievirus A9+B1+B2+B3+B4+B5+B6 Ab, Influenza virus A+B Ag 。
        2. 單獨測量多個分析物,則分析物為有空格包圍的連接號 (&) 分隔。
          如:Influenza virus A & B Ag 。
      2. 臨床處置(challenge) <[time delay] post [amount] [substance] [route])>
        1. 時間:分/時/日/週/月等。
          如:Glucose^1H post meal。
        2. 順序:第n套檢體。
          如:Glucose^1st specimen。
      3. 標準化或調整(any standardization or adjustment) :<adjustment>
        1. 區分校正或調整值與未校正測量值。
          如:Calcium.ionized^^adjusted to pH 7.4。
      4. 一次觀察獲得多個結果
        1. 報告在同一時間和/或在同一樣本上進行的重複觀察
          如:Bacteria identified^^^2
    2. 測量單位屬性結構為主要名稱+子名稱。
      如:RBCs 紅細胞成分的測量單位屬性mapping。
      "per mass of hemoglobin"是質量含量(MCnt)。
      "per liter of blood"是質量濃度(MCnc)。
      "per red blood cell"的量是實體質量EntMass。
    3. 檢驗時間屬性結構如含有時間的修飾,是以"^"分隔。
      如:量測8 小時心率heart rate 的最大值8H^max。
    4. 檢體種類<system (sample)> 結構第一部分為檢體名稱,第二部分(選擇性)表示檢體來源以"^"分隔。
      如:檢體來源為病人^Patient。
  3. LOINC TERM 的六軸向命名規則
    1. 檢驗項目名稱命名規則
      1. 主要名稱為被檢測物質的名稱。
        如:以A 型肝炎病毒為主要檢測名稱"Hepatitis A antibodies (Ab)",非以抗體為其主要名稱"Antibodies, Hepatitis A"。
      2. 在提及藥物的濃度或敏感度時,是以使用藥物的通用學名,而非商品名稱。
        藥物代謝常使用"nor"形式而不是"desmethyl"。
        如:Propranolol (普萘洛爾),非以商品名稱 Inderal 表述;nordoxepin,非以 desmethyldoxepin 表述。
      3. 在描述診斷該疾病的檢驗時,使用生物體的完整分類名稱或病毒名稱(而非疾病)。LOINC 內含細菌名稱時,是依據 <International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology > 中的完整細菌名稱;病毒名稱是依據 <Index Virum > 。如: "Orientia tsutsugamushi Ab" 非以 "Scrub typhus (恙蟲病) Ab" 表述。
      4. Species and groups of species: SP 標示為未知的單一物種;SPP 標示為屬(genus)之下的物種集。
        如:"Coffea spp Ab.IgG" 擬桿菌門的抗體IgG 檢驗,"Mycobacterium sp identified" 結核菌群的鑑定。
      5. 當檢測特定生物物種的抗原,但交叉反應導致其他生物體被辨識時,名稱應為檢測目標的主要生物體。
      6. 避免使用結合後的名詞,除非作為同義詞名稱的一部分。檢測標的物請使用其名詞。
        如:血小板以"Platelet"表述,而非血栓細胞"thrombocytes";心肌抗體以名詞 "Myocardium Ab" 而非形容詞"Myocardial Ab" 呈現。
      7. 維生素以其化學名稱而非編號。
        如:維生素"thiamine"而非 Vitamin B1,但營養學領域會使用廣為接受的名稱。
      8. 血清學檢測需釐清是測量抗原(Ag)還是抗體(Ab),並避免多餘的ANTI-X。
        如:"anti-smooth muscle Ab" 應表示為"Smooth muscle Ab" (平滑肌抗體)。
      9. 梅毒快速病毒性抗體測試(VDRL)請以Reagin Ab 為其標準名稱。
      10. 使用化學名稱表示陰離子(anion),而不是酸類(acid)的名稱。醇類請使用單一字詞名稱。希臘字母請以英文名稱表示。
      11. 避免使用total 在檢驗項目名稱裡,除非其表示分數的分母。時間單位的縮寫,例如Y 代表年,D 代表日,W 代表週。這僅適用於作為測量單位的時間。
      12. 分析物名稱中的標點符號避免使用特殊字符,例如逗號、破折號和括號。
      13. 所有名稱均不區分大小寫。但從 2019 年 6 月開始,LOINC 版本 2.66 開始,根據Institute for Safe Medication Practices 推薦的列表對名稱相似的藥物採用大寫字母以辨識。
        如:"Lua"以L little u super little a Ab"呈現。
      14. 數字應以阿拉伯語形式表示。除非像Coagulation factor VIII 抗凝血因子這類傳統以使用羅馬數字表示。
      15. 使用" exp "來表示Component 中的指數。
        如:指數的2.7 次方表示如Myocardial mass/Height exp 2.7。
      16. 檢驗項目名稱常見全名。
        如:名稱以全名表示而非縮寫,如"total", "fraction", "oxygen", "Alpha", and "Beta"。
      17. 檢驗項目名稱常見縮寫
        Ab: Antibody。
        Ag: Antigen。
        DNA: Deoxyribonucleic acid。
        HIV: Human immunodeficiency virus。
        HLA: Human histocompatibility complex derived antigens。
        HTLV I: Human t-cell lymphotropic virus-I。
        Ig "X": Immunoglobulins (e.g., IgG for immunoglobulin G, IgM for immunoglobulin M)。
        NOS: Not otherwise specified。
        RNA: Ribonucleic acid。
        rRNA: Ribosomal ribonucleic acid。
    2. 測量單位屬性結構為主要名稱+子名稱,依特性區分定量與定性,命名規則說明如下:
      1. 定量特性:同一物質相關的不同類型的量:
        1. 主要名稱:質量Mass、物質Substance、催化活性Catalytic activity、數字Number、任意Arbitrary。
        2. 子名稱:濃度Concentrations、含量Contents、比率Ratios、分數、Fractions、速率Rates。
          如:常見的組合為任意濃度ACnc。
          主要名稱如固定以質量Mass ,常見的子名稱組合:
          Mass Concentration (MCnc)
          Mass Content (MCnt)
          Mass ratio (Mrto)
          Mass fraction (MFr)
          Mass rate (MRat)
      2. 定性特性:
        1. 存在或閾值 (Presence or Threshold, PrThr)。
        2. 存在或辨識 (Presence or identity, Prid)。
        3. 類型 (Type):存在已知的情況下識別特定分析物的測定。
          如:已知含有肺炎鏈球菌的分離株以確定特定血清型,則鑑別的血清型別測量單位屬性為Type。
        4. Seq (核苷酸序列) 和Loc (位置)。
    3. 檢驗時間屬性 <kind of property> 命名規則:
      1. point or moment in time: 特定一個時點或時刻進行測量。
      2. time interval: 在指定時間間隔內測量的某些"平均"屬性。
        1. 最常見的是24H (採集時間可能為 23 小時,但仍稱為 24 小時研究)。
        2. Stdy 研究期間(未指定具體時間)。
        3. Enctr 到院期間(急診室就診、住院等)。
      3. 常見的時間修飾縮寫:
        min : Minimum value over interval
        max : Maximum value over interval
        frst : First value observed during an interval
        last : Last value observed during an interval
        mean : Mean of all of the values observed on the interval (This is the default selection.)
    4. 檢體種類 <system (sample)> 命名規則:
      1. 檢體名稱
        1. 生化檢驗的檢體通常為血清、尿液、血液和腦脊髓液;而微生物培養之檢體則來自於多樣的來源。
        2. Body fld 的設計主要是表示血清、血漿、血液、尿液和腦脊髓液以外的體液(生物液體)。但如明確知道檢體名稱如胸肋膜液、腹膜液、關節液和其他類型的液體,應盡可能對應存在的LOINC TERM。
        3. XXX 的設計主要是用於辨識未知或未指定的物質,可以是固體或液體;可以是生物或非生物的物質。
        4. 當血清或血漿檢測在臨床上等效時,檢體應記錄為Ser/Plas,意思是"血清或血漿"。
        5. 如果對樣本組合進行檢驗(如腦脊液和血漿中發現的物質的比例),則樣本類型用"+"連接,例如:Plas+CSF、Ser+CSF 或Isolate+Ser。
      2. 檢體來源
        1. 預設為病人 (^Patient)。
        2. 可用於指示之檢體來源別。
          如:血液製品單位(血品/BPU)、骨膸損贈者、新生兒。
    5. 檢驗單位屬性命名規則:
      1. 定量(Qn):檢驗結果為連續數值或數值範圍。以整數、比率、實數或範圍的形式報告。測試結果值可以選擇包含來自集合 {<=, <, >, >=} 的關係運算符。
        "7"、"-7"、"0.125"、"<10.15"、">12000" , 1-10, 1:256。
      2. 順序(Ord):檢驗結果為具順序性的分類,如是否;1+、2+、3+;正負;有反應的、不確定的、不具反應的。
      3. 數量或順序(OrdQn):檢驗結果可以為Ord 或Qn,如微生物的敏感性試驗(或Agar diffusion、MIC 等)可以報告為耐藥、中度、敏感或抑菌圈的直徑。
      4. 名義(Nom):檢驗結果沒有順序性的名稱,如細菌名稱、編碼,或沒有自然排序的外觀類別,如黃色、透明、鮮紅色。
      5. 敘述(Nar):報告為文字敘述,多用於clinical LOINC。
      6. 文檔(Doc):報告格式(XML,HTML, PDF, JPG, 敘述性文字等)的文檔。
    6. 檢驗方法命名規則:
      1. 檢驗方法在生化和血液學檢驗,常因臨床緊急程度、工具的交換、調整儀器可產生相同結果等,因此檢驗方法的精細程度會以較廣義的方式去定義。
      2. 檢驗方法在免疫學/血清學檢驗,因測試的敏感性和特異性隨方法的不同而變化幅度很大,因此在微生物檢驗或凝血測試等會描述檢驗方法。
      3. 免疫分析:
        1. 檢測抗原和抗體連接的免疫分析法,例如EIA、ELISA、化學螢光和其他類似的測試。
        2. Immune blot (IB) 、immune diffusion 和免疫的流式細胞術 ( immune based flow cytometry (FC) ) 測試,因它們通常會產生多個相關的觀察結果,因此具有特定的檢驗方法名稱。
        3. 免疫熒光測試(IFA、DFA 和 ACIF)也有自己的檢驗方法類型,即Immune fluorescence (IF),因為它們可提供有關目標分析物的存在或數量及其在塗片、組織切片或細胞上的位置(或模式)的信息。
      4. 核酸鑑定方法:
        1. Probe 不包括核酸擴增或信號增強步驟的測定。
        2. Probe.amp.sig 短核酸片段與目標靶標特異的互補核酸序列結合,然後進行信號增強步驟,當探針與目標序列結合時產生的信號倍增,使其更容易檢測。
        3. Probe.amp.tar 核酸擴增步驟的測定如聚合酶鏈反應(PCR),其目標核酸使用雜交探針。
        4. Non-probe.amp.tar 核酸擴增,其目標核酸使用雜交探針以外的方法,例如熔解曲線分析或濁度測量。
      5. 分子遺傳學分析法:Molgen (Molecular genetics) 用以含括表示限制性片段長度多型性分析 (Restriction Fragment Length Polymorphysim, RFLP)、聚合酶鏈反應 (Polymerase chain reaction, PCR) 、以及基因定序(sequencing) 等檢測基因屬性的方法。
      6. 檢測上限:主要用於甲狀腺促進素和尿白蛋白,依廠商所需以區分檢測閾值至少有一個數值 (10 倍) 差異的測試,檢驗方法因應廠商開發所需,而有設定檢測上限,檢驗醫學領域認為此訊息相對使用何種檢驗方法來得重要。