臺灣醫療資訊標準大平臺要靠統一標準，來結合醫療與IT。在沒有網路的世界，資料交換得靠燒錄光碟、影印資料、打電話溝通，但這卻是目前臺灣電子病歷的現況。雖然有網路，但各家醫院的電子病歷系統並不相容，資料交換還是得仰賴傳統方法。 這也衍生出臺灣電子病歷面臨的3大痛點。 首先是資料標準不統一，即便大至醫學中心、小至診所幾乎已無紙化，但各自開發的電子病歷系統標準不一，因此病人跨院轉診時，其資料交換還是有障礙，得仰賴傳統方法彌補。 再來是規則標準不統一，健保申報規則得與時俱進、時常修改，尤其出現新適應症時，醫院IT就得跟著快速修改程式，基層院所更得花一筆費用，請委外廠商臨時修改健保申報程式，才能重新申報。若由政府統一健保申報規則，建置一套國家規則圖書館（Rule Library），就可統一修改、更新健保申報規則，再開放醫療院所下載即可。 還有一個痛點是應用程式不統一，因為醫療院所各自發展電子病歷系統，導致要導入智慧醫療應用程式時，得仰賴人工客製化改寫再導入，無法真正廣泛使用。

針對資料標準不統一的痛點，如同HTML、HTTP等網路標準促成網際網路的大爆發，FHIR可以被視為醫療資訊界的HTML，未資料交換提供共同框架。有了FHIR這個共通語言，電子病歷的資料互通門檻就大幅降低，跨院所資料交換也更容易，甚至電子病歷資料能透過FHIR，經患者許可連接到Apple Health等智慧醫療應用程式，來進行個人健康管理應用。這是衛福部推動醫界導入FHIR的原因。 不過，由於各地文化不同，有許多特殊醫療形態，比如臺灣有中醫、國產藥物，因此得制定自己的國家FHIR實作指引（簡稱IG），也就是一套操作說明，來說明如何使用FHIR規範。目前，在FHIR官方登記實作指引的國家有23個，臺灣也名列其中，目前已登記4個IG，包括臺灣核心實作指引（TW Core IG）。這個IG包含20大類、109個日常的醫療看診、照護項目，衛福部鼓勵民間在這基礎上擴展，比如發展出收集流感資料的IG、癌篩IG、長照IG、保險理賠IG等。 對於規則不統一的痛點，衛福部則推廣醫界導入CQL。CQL是一套醫療用的國際標準程式語言，包含了醫療概念和文法，其設計非常直覺、很好上手。衛福部計畫用CQL編寫健保申報、評鑑規則，並將這些規則置於國家規則圖書館（類似代碼庫），未來供醫界取用。 最後，對於應用程式標準不統一的問題，衛福部要推SMART，也就是以FHIR為基礎，發展而成的應用程式標準，就像iOS、Android一樣，如此就能快速擴展智慧醫療應用程式的使用。

衛福部資訊處於2025年3月12日正式啟動臺灣醫療資訊標準大平臺，力推產官學研醫攜手採用國際醫療資料交換標準FHIR、臨床品質語言CQL、醫療應用程式標準SMART，來實現資料統一、規則統一和應用程式統一的三大目標。 透過醫院電子病歷採用FHIR，可解決病人轉診時，不同醫院間交換醫療資料不便的痛點。而導入CQL，則能由政府統一健保申報規則程式，一旦規則更動，各家醫院不必再自行修改程式、從政府網站下載即可，而且，導入CQL也有助於醫院評鑑的標準化。至於SMART on FHIR就像是醫療應用程式的App商店，以公認標準讓開發者打造各種智慧應用或AI程式，來發揮醫療資料價值。 未來將加強推動醫療資料交換標準FHIR、臨床品質語言CQL和醫療應用程式標準SMART等3大標準，透過設置專屬網站和提案系統，鼓勵醫療院所和廠商提出FHIR IG內容，打下臺灣智慧醫療發展基礎。最終目標是打造世界級的臺灣智慧醫療基礎建設、形塑生態系，以利於未來10年、20年智慧醫療發展。